La poussée

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La goute

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dans Boulot

Présentation et prix à ICIMTH 2020 !

J'ai présenté mes travaux sur l'utilisation des boîtes arc-en-ciel pour déterminer les synergies entre médicaments à ICIMTH 2020.

Mon article était intitulé "Visualization of potential drug synergies". Il est disponible ici et la présentation ci-dessous en vidéo :

icimth_video.mp4

Et j'ai obtenu un prix du meilleur article (Best paper award) !

Mes étudiants et collègues ont également présenté quatre papiers :

Le menu

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dans Boulot

Nouvel article "Implementation of an ontological reasoning to support the guideline-based management of primary breast cancer patients in the DESIREE project"

J'ai publié un nouvel article :

journalif [j60] Bouaud J, Pelayo S, Lamy JB, Prébet C, Ngo C, Teixeira L, Guezennec G, Séroussi B. Implementation of an ontological reasoning to support the guideline-based management of primary breast cancer patients in the DESIREE project. Artificial Intelligence in Medicine 2020;108:101922

dans Boulot

Nouvel article pré-publié "A data science approach to drug safety"

J'ai pré-publié un nouvel article :

preprint [p1] Lamy JB. A data science approach to drug safety: Semantic and visual mining of adverse drug events from clinical trials of pain treatments. Arxiv preprint arxiv:2006.16910 2020

dans Oiseaux

Oiseaux : Parc du Sausset

Observation d'oiseaux au parc départemental du Sausset, Villepinte.

Espèces photographiées (2): Grèbe huppé, Hirondelle rustique (2x)

dans Oiseaux

Oiseaux : Parc Georges-Valbon

Observation d'oiseaux au parc Georges-Valbon, La Courneuve.

Espèces photographiées (2): Fuligule milouin, Fuligule morillon

Owlready2 0.24 est disponible !

Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

Cette nouvelle version inclut des changements mineurs et des corrections de bogues. Elle utilise désormais le gestionnaire de version Git (au lieu de Mercurial).

Voici les modifications :

  • Support intersection of searches (e.g. World.search(...) & World.search(...))

  • Add owlready2.reasoning.JAVA_MEMORY

  • Move development repository to Git

  • Bugfixes: - Fix parsing of NTriples files that do not end with a new line - Fix KeyError with Prop.python_name when several properties share the same name - Fix get_ontology() calls in Python module imported by ontologies in a World that is not default_world - Fix use of PyMedTermino2 in a World that is not default_world - Fix World.as_rdflib_graph().get_context(onto) for ontology added after the creation of the RDFLIB graph - Fix destroying SWRL rules - Fix disjoint with non-atomic classes

La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2

Le langage

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La capote

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L'escalade

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Caro-oigneuf

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dans Boulot

Nouvel article "Explainable decision support through the learning and visualization of preferences from a formal ontology of antibiotic treatments"

J'ai publié un nouvel article :

journalif [j54] Lamy JB, Sedki K, Tsopra R. Explainable decision support through the learning and visualization of preferences from a formal ontology of antibiotic treatments. Journal of Biomedical Informatics 2020;104C:103407