Python et les ontologies, Jean-Baptiste Lamy, ENI Éditions, 310 pages Sombre comme l'Aurore, Jean-Baptiste Lamy, Éditions 38, 466 pages

Le blog et site personnel de Jean-Baptiste Lamy (Jiba).

Mon roman "Sombre comme l'Aurore - La légende de Tienn Halidenn" vient de sortir aux Éditions du 38 !

Mon livre "Python et les ontologies" est toujours disponible aux éditions ENI.

Bonne lecture !

Caro-oigneuf

_images/caro_oigneuf.png
dans Boulot

Nouvel article "Explainable decision support through the learning and visualization of preferences from a formal ontology of antibiotic treatments"

J'ai publié un nouvel article :

journalif [j54] Lamy JB, Sedki K, Tsopra R. Explainable decision support through the learning and visualization of preferences from a formal ontology of antibiotic treatments. Journal of Biomedical Informatics 2020;104C:103407

dans Boulot

Nouvel article "Somatic mitochondrial mutations in oral cavity cancers among senegalese patients"

J'ai publié un nouvel article :

journal [j51] Toure S, Mbaye F, Gueye MD, Fall M, Dem A, Lamy JB, Sembene M. Somatic mitochondrial mutations in oral cavity cancers among senegalese patients. Asian Pacific journal of cancer prevention (APJCP) 2019;20(7):2203-2208

L'échassier

_images/echassier.png

Le bruyant des couffins

_images/bruyant_des_couffins.png
dans Oiseaux

Oiseaux : Bruxelles

Observation d'oiseaux dans la ville de Bruxelles (Belgique).

Espèce photographiée: Perruche à collier (2x)

dans Boulot

Présentation à EGC 2020 !

J'ai présenté mes travaux sur l'aide à la décision visuelle pour le traitement du cancer du sein dans le projet DESIREE, au congrès EGC 2020 à Bruxelles.

Mon papier était intitulé "Intelligence artificielle explicable pour le cancer du sein : Une approche visuelle de raisonnement à partir de cas". Il est disponible ici et la présentation .

J'ai également participé à l'atelier Visualisation d'informations, interaction et fouille de données (VIF) organisé lors d'EGC, où j'ai présenté des travaux préliminaires intitulés "Combiner arbres phylogénétiques et visualisation d’ensembles" (disponible ici et la présentation ).

L'explorateur

_images/explorateur.png

Owlready2 0.23 est disponible !

Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

Cette nouvelle version inclut des changements mineurs et des corrections de bogues.

Voici les modifications :

  • Add get_parents_of(), get_instances_of(), get_children_of() methods to ontology, for querying the hierarchical relations defined in a given ontology

  • Use Thing as default value for restrictions with number, instead of None

  • Add 'filter' parameter to save(), for filtering the entities saved (contributed by Javier de la Rosa)

  • Bugfixes: - Fix value restriction with the false value - Fix blank node loading from different ontologies - Fix constructs reused by several classes - Fix 'Class.is_a = []' was not turning the list into an Owlready list - Fix destroy_entity() - was not destroying the IRI of the entity - Improve setup.py: ignore Cython if Cython installation fails

La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2

dans Oiseaux

Oiseaux : Paris canal de l'Ourcq

Observation d'oiseaux à Paris sur le canal de l'Ourcq à la Villette.

Espèces photographiées (5): Foulque macroule, Grand cormoran (x2), Grèbe castagneux, Mouette rieuse (x2), Poule d'eau

Le premier mot

_images/premier_mot.png

C'est le mien !

_images/le_mien.png

La loi de Clément

_images/loi_physique.png
dans Boulot

Nouvel article "AntibioGame®"

J'ai publié un nouvel article :

journalif [j52] Tsopra R, Courtine M, Sedki K, Eap D, Cabal M, Cohen S, Bouchaud O, Mechaï F, Lamy JB. AntibioGame®: A serious game for teaching medical students about antibiotic use. International Journal of Medical Informatics 2020;136:104074