J'ai pré-publié un nouvel article :

[p3] Lamy JB, Mouazer A, Sedki K, Dubois S, Falcoff H. Adaptive questionnaires for facilitating patient data entry in clinical decision support systems: Methods and application to STOPP/START v2. Arxiv preprint arxiv:2309.10398 2023

Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

Cette version inclut un module d'observation permettant d'ajouter un listener à n'importe quelle entité, afin d'être notifier lorsque les relations de l'entité sont modifiées.

Elle introduit aussi une nouvelle syntaxe pour annoter les relations : AnnotatedRelation(s,p,o).comment = ["abc"] (NB l'ancienne syntaxe reste supportée).

Voici les modifications :

• New syntax for annotations on relation, e.g. AnnotatedRelation(s,p,o).comment = "abc" (the old syntax remains supported)

• Optimize annotations on relations

• Support GRAPH clauses in SPARQL INSERT queries

• Observation framework (see owlready2.observe and doc on the observation framework)

• Bugfixes: - Fix the update of equivalent_to after destroying a class - Fix the update of annotations on class when modified with SPARQL queries - Fix SPARQL GRAPH clause in SELECT queries when querying the graph as a variable and all triples are not inside the GRAPH clause - Fix LANGMATCHES SPARQL function - Prevent multiprocessing loading of large ontologies when fork is not available (i.e. on Mac) - Fix subproperties parent classes when destroying a property - Fix loading of TransitiveProperty, SymmetricProperty, AsymmetricProperty, ReflexiveProperty, IrreflexiveProperty

La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2

Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

Cette version inclut un changement incompatible avec les précédentes: les literaux avec des languages différents sont désormais considérés comme différents. Par exemple:

• locstr("Test", "en") != "Test"

• locstr("Test", "en") != locstr("Test", "fr")

ce n'était pas le cas dans les versions précédentes, et cela causait des bogues et des confusion entre literaux.

J'en profite pour mentionner un nouveau projet: FullPy est un module Python pour concevoir des applications web entièrement en Python. Il utilise Owlready pour la persistance et la sémantique des données. Pour plus d'informations sur FullPy sont disponibles ici :

• https://fullpy.readthedocs.io/en/latest/

Suite à un bogue de dernière minute, il n'y a pas de version 0.42.

Voici les modifications :

• INCOMPATIBLE CHANGE: Consider literal with different language as different

• Support GRAPH clauses in SPARQL queries

• World now supports custom lock (e.g. World(lock = ...))

• Bugfixes: - Fix World(enable_thread_parallelism = True) (was named enable_gevent) - Fix blank nodes in rdflib_store - Fix FILTER in SPARQL when the filter was just after a recursive query - Fix recursive query in SPARQL involving variables in their right part - Fix SPARQL query with annotations containing entities - Fix property creation when using a Union in the '>>' syntax (e.g. class Prop((MyClass | MyOtherClass) >> str): pass) - Fix UMLS extraction in PyMedTermino2 - Fix Class IRI with brackets (or other special characters) when writing RDF/XML file

La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2

FullPy est un module Python pour développer des applications web client-server sémantiques, entièrement en Python.

Ceci est la première version de FullPy.

FullPy peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/fullpy

Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

Cette version introduit un travail sur la parallélisation à base de threads. La lecture de gros fichiers OWL est désormais plus rapide (~ 25% plus rapide avec GO), et Owlready peut exécuter des requêtes SPARQL de manière parallélisée. Se référer à la doc plus plus d'info (https://owlready2.readthedocs.io/en/latest/sync.html).

Voici les modifications :

• Parallelized huge OWL file parsing (about 25% faster on GO)

• Parallelized SPARQL queries (see owlready2.sparql.execute_many() and execute(spawn = True))

• Bugfixes: - Fix Class.INDIRECT_get_class_properties() with restriction on Inverse(Prop) - Fix Restriction of type HasSelf - Fix delattr in destroy_entity() - Fix blank nodes importation from RDFlib - Fix ', + and - in FTS search

La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2