Python et les ontologies, Jean-Baptiste Lamy, ENI Éditions, 310 pages Sombre comme l'Aurore, Jean-Baptiste Lamy, Éditions 38, 466 pages

Le blog et site personnel de Jean-Baptiste Lamy (Jiba).

Mon roman "Sombre comme l'Aurore - La légende de Tienn Halidenn" vient de sortir aux Éditions du 38 !

Mon livre "Python et les ontologies" est toujours disponible aux éditions ENI.

Bonne lecture !

dans Boulot

Nouvel article pré-publié "A data science approach to drug safety"

J'ai pré-publié un nouvel article :

preprint [p1] Lamy JB. A data science approach to drug safety: Semantic and visual mining of adverse drug events from clinical trials of pain treatments. Arxiv preprint arxiv:2006.16910 2020

dans Oiseaux

Oiseaux : Parc du Sausset

Observation d'oiseaux au parc départemental du Sausset, Villepinte.

Espèces photographiées (2): Grèbe huppé, Hirondelle rustique (2x)

dans Oiseaux

Oiseaux : Parc Georges-Valbon

Observation d'oiseaux au parc Georges-Valbon, La Courneuve.

Espèces photographiées (2): Fuligule milouin, Fuligule morillon

Owlready2 0.24 est disponible !

Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

Cette nouvelle version inclut des changements mineurs et des corrections de bogues. Elle utilise désormais le gestionnaire de version Git (au lieu de Mercurial).

Voici les modifications :

  • Support intersection of searches (e.g. World.search(...) & World.search(...))

  • Add owlready2.reasoning.JAVA_MEMORY

  • Move development repository to Git

  • Bugfixes: - Fix parsing of NTriples files that do not end with a new line - Fix KeyError with Prop.python_name when several properties share the same name - Fix get_ontology() calls in Python module imported by ontologies in a World that is not default_world - Fix use of PyMedTermino2 in a World that is not default_world - Fix World.as_rdflib_graph().get_context(onto) for ontology added after the creation of the RDFLIB graph - Fix destroying SWRL rules - Fix disjoint with non-atomic classes

La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2

Le langage

_images/langage.png

La capote

_images/capote.png

L'escalade

_images/escalade.png

Caro-oigneuf

_images/caro_oigneuf.png
dans Boulot

Nouvel article "Explainable decision support through the learning and visualization of preferences from a formal ontology of antibiotic treatments"

J'ai publié un nouvel article :

journalif [j54] Lamy JB, Sedki K, Tsopra R. Explainable decision support through the learning and visualization of preferences from a formal ontology of antibiotic treatments. Journal of Biomedical Informatics 2020;104C:103407

dans Boulot

Nouvel article "Somatic mitochondrial mutations in oral cavity cancers among senegalese patients"

J'ai publié un nouvel article :

journal [j51] Toure S, Mbaye F, Gueye MD, Fall M, Dem A, Lamy JB, Sembene M. Somatic mitochondrial mutations in oral cavity cancers among senegalese patients. Asian Pacific journal of cancer prevention (APJCP) 2019;20(7):2203-2208

L'échassier

_images/echassier.png

Le bruyant des couffins

_images/bruyant_des_couffins.png
dans Oiseaux

Oiseaux : Bruxelles

Observation d'oiseaux dans la ville de Bruxelles (Belgique).

Espèce photographiée: Perruche à collier (2x)

dans Boulot

Présentation à EGC 2020 !

J'ai présenté mes travaux sur l'aide à la décision visuelle pour le traitement du cancer du sein dans le projet DESIREE, au congrès EGC 2020 à Bruxelles.

Mon papier était intitulé "Intelligence artificielle explicable pour le cancer du sein : Une approche visuelle de raisonnement à partir de cas". Il est disponible ici et la présentation .

J'ai également participé à l'atelier Visualisation d'informations, interaction et fouille de données (VIF) organisé lors d'EGC, où j'ai présenté des travaux préliminaires intitulés "Combiner arbres phylogénétiques et visualisation d’ensembles" (disponible ici et la présentation ).