Le blog et site personnel de Jiba !

Le mensiversaire

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dans Boulot

Deux présentations à iV 2019 !

J'ai présenté mes travaux sur les boîtes arc-en-ciel au congrès International Conference Information Visualisation (iV) 2019.

Le premier article est intitulé "Visual explanation of simple neural networks using interactive rainbow boxes" et disponible ici et la présentation .

Le second article est intitulé "Proportional visualization of genotypes and phenotypes with rainbow boxes: methods and application to sickle cell disease" et disponible ici et la présentation . Il s'agit d'un travail en collaboration avec un doctorant et des collègues Sénégalais et le CERPAD.

dans Boulot

Présentation à IC 2019 !

J'ai présenté des travaux sur l'apprentissage de préférences au congrès Ingénierie des Connaissances (IC) 2019, lors de la Plateforme Francophone d'Intelligence Artificiel (PFIA).

L'article est intitulé "Apprentissage de préférences à partir d'une ontologie formelle : méthodes et application en antibiothérapie" et disponible ici et la présentation .

Les biberons

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Martine

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Owlready2 0.18 est disponible !

Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

Cette nouvelle version corrige le support UMLS sous Windows (problème d'encodage de caractères) dans PyMedTermino2. Elle évite également les duplications de triplets RDF dans le quadstore.

Voici les modifications :

  • Add UNIQUE constraints for preventing dupplicated RDF triples in the quadstore

  • Add Individual.INDIRECT_is_a / Individual.INDIRECT_is_instance_of

  • Add isinstance_python() (faster than isinstance(), but do not consider equivalent_to relations)

  • Bugfixes: - Force UTF-8 encoding when importing UMLS - Be more tolerant when loading OWL file

La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2

Le livre de bébé

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dans Boulot

Nouvel article "RainBio"

J'ai publié un nouvel article :

journal [j26] Lamy JB, Tsopra R. RainBio: Proportional visualization of large sets in biology. IEEE Transactions on Visualisation and Computer Graphics 2019;accepted

L'évolution

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La prise

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Bienvenue bébé

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Owlready2 0.17 est disponible !

Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

Cette nouvelle version supporte l'édition des règles SWRL et corrige des problème dans PyMedTermino2.

Voici les modifications :

  • SWRL rule support

  • Allows importing UMLS suppressed terms

  • Uncache entities when relaoding an ontology

  • Bugfixes: - Fix PyMedTermino2 installation - Fix data property value inferrence with debug = 1 - Fix sort() in LazyList (thanks fiveop!) - Fix World.get() and add World.get_if_loaded() - Add appropriate error message when importing UMLS with Python 3.6 - Fix individuals belonging to multiple, equivalent, classes after reasoning

La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2

Les pensées

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Les semelles glissantes 2

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