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Le blog et site personnel de Jiba !

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Quelques photos d’Athène

dans Voyages

Quelques photos prises à Athène : la bibliothèque d’Adrien, l’Acropole, le jardin botanique, le stade panathénaïque, le mont Lycabèthe,…

Vidéo de démonstration du projet VIIIP

dans Boulot

Voici une vidéo de démonstration du projet VIIIP (Visualisation Intégrée de l’Information sur l’Innovation Pharmaceutique), financé par l’ANSM. Cette vidéo a été réalisé et diffusé lors de l’évaluation du laboratoire LIMICS par l’HCERES.

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Bonne année 2018 !

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Noël 2017

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Owlready2 0.5 est disponible !

Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

Cette nouvelle version corrige plusieurs bogues.

Elle peut être télécharger sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2

Document d’HDR

dans Boulot

Mon document d’HDR (Habilitation à Diriger des Recherches), intitulée « Représentation, iconisation et visualisation des connaissances : Principes et applications à l’aide à la décision médicale », est disponible en ligne ici : HDR .

Soutenance d’HDR

dans Boulot

Mardi prochain (21/11/2017), je soutiendrai mon HDR (Habilitation à Diriger des Recherches), intitulée « Représentation, iconisation et visualisation des connaissances : Principes et applications à l’aide à la décision médicale ». La soutenance aura lieu le mardi 21 novembre 2017 à 14h à Rouen à l’adresse suivante :

Bâtiment CURIB, 25 rue Lucien Tesnière, 76130 Mont Saint Aignan

Le jury sera le suivant :

  • Gilles Venturini (rapporteur)
  • Sandra Bringay (rapportrice)
  • Nhan le Thanh (rapporteur)
  • Thierry Lecroq (examinateur)
  • Marie-Christine Jaulent (examinatrice)
  • Lina F Soualmia (examinatrice)

La soutenance sera suivie d’un pot.

Résumé :

Les connaissances sont de plus en plus nombreuses, tandis que le temps disponible pour se les approprier est limité. Dans le domaine médical, le format textuel reste la référence. Mais les médecins n’ont guère le temps de se référer aux textes durant leurs consultations. Les systèmes automatiques d’aide à la décision clinique ont souvent été présentés comme une solution pour résoudre le problème de l’explosion des connaissances médicales, mais ils n’ont pas abouti au succès initialement espéré.

Nous proposons une approche différente pour l’aide à la décision : la visualisation des connaissances. Il s’agit de présenter les connaissances de manière visuelle à l’utilisateur, afin de faciliter la prise de décision. Nous étudierons cette nouvelle approche selon une démarche multidisciplinaire, en 4 étapes :

  1. La représentation et la formalisation des connaissances
  2. La visualisation iconique
  3. La visualisation structurelle
  4. L’intégration de la visualisation au sein des applications, et leur évaluation

Cette démarche sera illustrée au travers de trois projets auxquels j’ai participé en tant que postdoc puis maître de conférences au laboratoire LIM&BIO puis LIMICS. Nous montrerons qu’il est possible de visualiser des connaissances abstraites complexes à l’aide d’icônes et de techniques de visualisation, mais également que cette approche conduit à de bonnes performances et une bonne acceptation lorsqu’elle est mise en œuvre pour l’aide à la décision.

EditObj 3 0.1 is out !

This is the first stable release of EditObj 3.

It is a full rewrite of EditObj 2, and it now supports Qt and HTML.

It is available on PyPI (Python Package Index).

Songwrite 3 0.1

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Songwrite 3 0.1 est disponible ! Cette nouvelle version est une réécriture complète avec Python 3 et Qt. Amusez-vous bien!

Elle est disponible sur PyPI (Python Package Index) et peut être installée sous Linux avec la commande pip:

pip3 install songwrite3

Avant cela, n’oubliez pas d’installer Python3, pip et PyQt5 à partir de votre distribution Linux.

Owlready2 0.4 est disponible !

Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

Les principales nouveautés de la version 2 - 0.4 sont :

  • l’interrogation des relations définies pour un individu (via les méthodes .get_properties(), .get_inverse_properties() et .get_relations())
  • l’amélioration de la méthode .search() en prenant en compte l’héritage et les relations inverses
  • l’optimisation des requêtes récursives en SQL
  • plusieurs corrections de bogues

Cette nouvelle version peut être télécharger sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2