Owlready2 0.26 est disponible !

Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

Cette nouvelle version inclut un nouveau module pour afficher les entités en Logiques de Description (DL), et des corrections de bogues.

Voici les modifications :

  • Module owlready2.dl_render allows rendering entities to Description Logics (contributed by Simon Bin)

  • Bugfixes: - Adjustment in the comparison of strings from SameAs and DiferrentFrom, allowing equal comparison regardless of the case-sensitive (contributed by Thiago Feijó) - Fix transitive equivalent_to relations between classes and OWL constructs - Fix AnnotationProperty[entity] where entity is a predefined OWL entity (e.g. comment or Thing) - Fix entity.AnnotationProperty where entity is a predefined OWL entity (e.g. comment or Thing) - Fix HermiT when reasoning on several ontologies with imports statement - Ignore "A type A", with a warning

La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2

dans Boulot

Séminaire QuanTIM au SESSTIM

J'ai présenté mes travaux sur l'aide à la décision visuelle à partir de cas et leur application au traitement du cancer du sein, issus du projet DESIREE.

La présentation est disponible ici en vidéo :

>

Le déji

_images/dj.png

Le miracle

_images/miracle.png

Je suis prof !

_images/je_suis_prof.png

Owlready2 0.25 est disponible !

Owlready2 est un module Python pour la programmation orientée ontologie. Il permet de charger des ontologies OWL 2.0 et de les manipuler de manière transparente en Python.

Cette nouvelle version inclut plusieurs nouveautés, et des corrections de bogues.

Voici les modifications :

  • Allow the declaration of custom datatypes with declare_datatype()

  • Support the annotation of annotations (e.g. a comment on a comment)

  • search() now support the "subproperty_of" argument

  • search() now support the "bm25" argument (for full-text searches)

  • Bugfixes: - Fix Concept.descendant_concepts() in PymedTermino2 - Update already loaded properties when new ontologies are loaded - Now accept %xx quoted characters in file:// URL - Improve error message on punned entities - Property.get_relations() now considers inverse properties - Fix "AttributeError: 'mappingproxy' object has no attribute 'pop'" error - Fix Thing.instances()

La nouvelle version peut être téléchargé sur PyPI (Python Package Index) : https://pypi.python.org/pypi/Owlready2

dans Boulot

Nouvel article "Identifying the mitochondrial DNA mutations that cause cancer"

J'ai publié un nouvel article :

journal [j64] Mbaye F, Lamy JB, Sembene M. Identifying the mitochondrial DNA mutations that cause cancer. Research Outbreak 2020;117:50-53

Vanité des futilités humaines

_images/vanite.png
dans Boulot

Nouvel article "How to interact with medical terminologies?"

J'ai publié un nouvel article :

journalif [j63] Marcilly R, Douze L, Ferré S, Audeh B, Bobed C, Lillo-Le Louët A, Lamy JB, Bousquet C. How to interact with medical terminologies? Formative usability evaluations comparing three approaches for supporting the use of MedDRA by pharmacovigilance specialists. BMC Medical Informatics and Decision Making 2020;20:261

dans Boulot

Présentation à iV 2020

J'ai présenté mes travaux au congrès Information Visualisation (iV) 2020.

L'article s'intitule "Comparison of four visual analytics techniques for the visualization of adverse drug event rates in clinical trials" est disponible ici et la présentation ou en vidéo ci-dessous :

iv2020_video.mp4

La chaise à porteur

_images/chaise_a_porteur.png

Le bisou

_images/bisou.png
dans Voyages

Photos d'animaux au CERZA

Voici des photos d'animaux prises au parc zoologique du CERZA !

Le robot marsien

_images/robot.png